文明是遊戲中可選擇的陣營。在 世紀帝國II：帝王世紀中，可以選擇的文明有13個。分別為「中國」、「日本」、「蒙古」、「波斯」、「薩拉森」、「土耳其」、「拜占庭」、「哥德」、「維京」、「條頓」、「法蘭克」、「凱爾特」、「不列顛」、
資料片「世紀帝國：征服者入侵」新增5個文明。分別為「西班牙」、「匈奴」、「韓國」、「瑪雅」、「阿茲特克」，玩家可使用的文明增加為18個。
後來經由玩家自己更新的資料片「被遺忘的王朝」再度新增了5個文明。分別為「印度」、「斯拉夫」、「馬紮爾」、「義大利」、「印加」。可使用的文明增加到前所未見的23個。
而2015年的官方新資料片「非洲王朝」新增了4個文明，這也是本系列繼初代的「迦太基」後第一次出現非洲文明。新增的文明分別為：「衣索匹亞」、「馬里」、「柏柏爾」、「葡萄牙」。